Identificación fúngica en pacientes quemados. Un estudio retrospectivo y factores de riesgo / Fungal identification in burn patients. A retrospective study and risk factors

Resumen Se realizó un estudio retrospectivo de las infecciones fúngicas atendidas en un centro de quemados de alta complejidad situado en Buenos Aires, entre 2011 y 2014, mediante el análisis de las histo rias clínicas (n = 36). Las edades de los pacientes estuvieron entre 18 y 87 años, y 23 (63.9%) fueron mujeres. La extensión de la superficie corporal afectada más prevalente varió entre 30 y 50% (p = 0.03), y entre 71% y 100% en pacientes de menor edad, relacionándose con intentos de femicidio. En el 69.4% la profundidad de la quemadura fue grado 4, y en el 50% de los casos se observaron lesiones por inhalación, con una alta mortali dad (p = 0.04). El Candida score resultó de 3 en el 77.7% de los casos. Se usaron vías centrales y ventilación mecánica. Todos los pacientes recibieron tratamiento antibiótico y en 33 (91.7%) antifúngicos. La escisión qui rúrgica de la quemadura se practicó en 33 (91.7%) y los autoinjertos de piel en 29 (80.6%). La infección fúngica se desarrolló en una media de 21.4 días del ingreso en UCI. Se estudiaron 52 muestras de levaduras que se aislaron de urocultivo (42.3%), hemocultivo (26.9%), biopsia cutánea (9.6%), punta de catéter (15.4%) y aspirado traqueal (5.8%). Por cultivo microbiológico y métodos moleculares se identificaron a Candida albicans (53.8%), C. tropicalis (23.1%), C. parapsilosis sensu stricto (13.5%), C. krusei (5.8%), C. glabrata (1.9%) y C. dubliniensis (1.9%). Las infecciones fúngicas representan severas complicaciones en quemados con factores de riesgo.

Abstract A retrospective analysis of fungal infections was carried out in a health-care burn center between 2011 and 2014 using the patients' medical records (n = 36). Patients ranged from 18 to 87 years of age, with 23 (63.9%) being women. The most prevalent widespread total body surface area affected (TBSA) was 30-50% (p = 0.03), and 71-100% in younger patients, mainly associated with femicide. Fourth degree burns were revealed in 69.4% of the patients while in 50%, inhalation injuries were observed to represent a higher mortality rate (p = 0.04). The Candida score was 3 in 77.7% of cases respectively. Central venous catheter and mechanical ventilation were used. All patients received antibiotic treatment and 91.7% antifungal treatment. Surgical excision of the burn was performed in 33 (91.7%) patients, and skin autografting in 29 (80.6%). The median of the fungal infection devel oped was 21.4 days after admission to the ICU. The specimens analyzed involved 52 yeast samples isolated from different cultures: urine (42.3%), blood (26.9%), skin biopsy (9.6%), catheter tip (15.4%) and tracheal aspirate (5.8%). The use of microbiological culture and molecular methods allowed for the identification of Candida albicans (53.8%), C. tropicalis (23.1%), C. parapsilosis sensu stricto (13.5%), C. krusei (5.8%), C. glabrata (1.9%) and C. dubliniensis (1.9%). Fungal infections observed in skin burns lead to severe complications in at-risk patients.

Comparison of the identification results of Candida species obtained by BD PhoenixT and Maldi-TOF (Bruker Microflex LT Biotyper 3.1) / Comparación de los resultados de identificación de especies del género Candida obtenidos por BD PhoenixT y Maldi-TOF (Bruker Microflex LT Biotyper 3.1)

In patients with invasive fungal infections, the accurate and rapid identification of the genus Candida is of utmost importance since antimycotic sensitivity is closely related to the species. The aim of the present study was to compare the identification results of species of the genus Candida obtained by BD PhoenixT (Becton Dickinson -#91;BD-#93;) and Maldi-TOF MS (Bruker Microflex LT Biotyper 3.1). A total of 192 isolates from the strain collection belonging to the Mycology Network of the Autonomous City of Buenos Aires, Argentina, were analyzed. The observed concordance was 95%. Only 10 strains (5%) were not correctly identified by the BD PhoenixT system. The average identification time with the Yeast ID panels was 8h 22 min. The BD PhoenixT system proved to be a simple, reliable and effective method for identifying the main species of the genus Candida.

En pacientes con infecciones fúngicas invasoras, la identificación certera y rápida de las especies del género Candida es de suma importancia, ya que la sensibilidad a los antifúngicos está íntimamente relacionada con la especie. El objetivo del presente estudio fue comparar los resultados de identificación de especies del género Candida obtenidos con el equipo comercial BD PhoenixT (Becton Dickinson -#91;BD-#93;) y con la técnica de Maldi-TOF MS (Bruker Microflex LT Biotyper 3.1.) Se analizaron 192 aislamientos provenientes del cepario perteneciente a la Red deMicología de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina. La concordancia observada fue del 95%. Solo 10 cepas (5%) no fueron identificadas correctamente por el sistema BD PhoenixT. El tiempo promedio de identificación con los paneles Yeast ID fue de 8 h 22 min. El sistema BD PhoenixT demostró ser un método simple, confiable y efectivo para la identificación de las principales especies del género Candida.

Evaluación del rendimiento del sistema Rapid™ Yeast Pluz (Remel) a partir de 2 medios de cultivo diferentes / Performance evaluation of Rapid™ Yeast Plus (Remel) system from two different culture media

Dentro del género Candida, la especie más frecuentemente aislada de materiales clínicos es Candida albicans. Debido a la emergencia de otras especies que pueden presentar mayor índice de resistencia a los antifúngicos, se hace necesaria la identificación rápida de aquellas. El objetivo del presente trabajo fue evaluar el rendimiento del sistema RapID™ Yeast Plus a partir de subcultivos en 2 formulaciones diferentes, agar Sabouraud dextrosa modificado por Emmons (medio indicado en el inserto del equipo) y agar Sabouraud glucosado, que es el utilizado habitualmente en los laboratorios de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Se estudiaron 166 cepas de muestras clínicas provenientes de los distintos hospitales que integran la Red de Micología de la Ciudad de Buenos Aires. De los resultados obtenidos se concluye que se deben mantener las condiciones y el medio de cultivo indicado por el fabricante

Within the genus Candida, Candida albicans is the most commonly isolated species from clinical samples. Due to the emergence of other species which can show a higher index of antifungal resistance, a fast identification of these species is necessary. The aim of this work was to evaluate the performance of the RapID Yeast Plus system from two different subculture media formulations: Sabouraud dextrose agar adjusted by Emmons (the medium is indicated in the equipment insert) and Sabouraud glucose agar, which is the most frequently used in Buenos Aires City laboratories. One hundred and sixty-six clinical sample strains coming from different hospitals belonging to the Mycology Network of Buenos Aires City were studied. From the obtained results, we conclude that the conditions and culture medium indicated by the manufacturer should be followed